新时期生态农业必须是现代高效生态农业，建立在高效利用自然资源基础之上、注重发挥生态系统的整体功能、不断提高生态环境质量。现代高效生态农业的精髓是物质单元多次经过经济体内部的生产过程，目的是物质单元更多地附在产品上走出经济体，保障是用价值之船载上物质单元在经济体内畅通循环。新时期生态农业的基本发展思路是用系统化的政策法规保障，用规模化的运营模式承载，用现代化的科学技术武装。
    1 生态农业的主要特点
    1.1生态农业建立在高效利用自然资源基础之上
    根据区域自然条件和资源基础，生态农业可以灵活选择农业生态系统构成复合生态系统模式，进而提高空间和光能利用率，这有利于物质和能量的多层次利用，增加生物质产量。复合生态系统中物种的多样性，一方面为有害生物防控提供了天然条件，从而减少化学药剂的使用量；另一方面提高了物质循环和能量转化的效率，进行有机剩余物资源化利用，既增加了养殖业的饲料来源，又降低了种植业的化肥投入量。这样，在降低生产成本、提高经济效益的同时，又减少了农业污染，提高了农产品质量。
    1.2生态农业注重发挥生态系统的整体功能
    生态农业是涵盖农、林、牧、渔等种养业在内的综合经营体系,目的要在有限的土地和养殖水域上发挥生态系统的整体功能，实现综合效益的最大化。因此，生态农业要求根据当地的具体情况进行合适的种养业搭配，瞄准最高的整体产出水平。传统生态农业是小规模的种养业搭配，在最终效益上是有限的；而现代生态农业强调的是适度规模化的种养业搭配，能够充分发挥整体农业生态功能，以实现最佳的产出效益。
    1.3生态农业能够提高生态环境质量
    生态农业本身有很强的自净能力，可以在很大程度上减轻生产活动对生态环境的干扰。同时，生态农业注重恢复和提高土壤的肥力，减少化肥和农药的用量，土地退化和生态环境污染能够得到控制，农业与农村生态环境持续得到改善。此外，生态农业能够确保农产品的安全性，提高生态系统的稳定性和持续性，增强农业发展后劲。
    2 我国生态农业的现状
    早在20世纪80年代初期，我国就开始了生态农业建设。在“八五”和“九五”期间，100多个生态农业试点示范县总结实践了大量有效的生态农业模式，并初步形成了生态农业技术体系，取得了一些社会、经济和生态效益。但由于政策理论研究、生产经营和管理体系方面都存在不足，目前我国的生态农业还徘徊在小规模、低转换、微效益的传统生态农业阶段。
    2.1生产主体小，产业化水平低
    目前，我国的生态农业基本上都是原有家庭承包基础上的一家一户经营，不仅规模小，而且主要停留在生产阶段，农业产业链的其他环节都十分不健全，因此很难达到规模经济，必然制约着生态农业建设的规范化发展，同时也导致了抵御来自较大的经济环境和生态环境冲击的能力较低。另外，小的生产经营主体一般生态意识差，对生态农业的发展认识不足，农民往往追求经济利益和眼前利益，对规范化生态农业难以接受，导致生态农业的技术不易推广和广泛应用。
    2.2研究点散面窄，缺乏系统性
    一个完整的农业生态系统包含着很多组成成分，需要严密的理论支撑才能设计出适用的复合系统。以往针对生态农业的研究多侧重于单一学科，未形成系统、综合的研究。同时，对于发展生态农业的法律对策、战略方针、检测体系和标准化评价体系等问题的研究与生态农业发展脱节。此外，传统的生态农业技术体系基本上是对单一技术的简单加整，对复合生态农业系统的设计缺乏综合性技术措施的研究。而且实用技术到位率差，科技立项与农民的知识水平和经济承受能力脱节，技术结构不合理等问题也比较突出。
    2.3政策法规保障乏力，资金短缺
    目前，缺乏全国生态农业的总体目标、指导思想、发展措施和保障机制等纲领性的文件，生态农业建设的政策激励机制不健全，实施主体缺乏积极性；全国性生态农业建设法规条例还未制定，仅依靠《全国生态农业建设技术规范》等指导性文件进行生态农业建设；此外，传统生态农业建设无法取得独立的财政扶持，资金渠道有限,建设项目难以全面展开，长期处于初级阶段，建设进程缓慢甚至停滞。
    3 新时期生态农业发展要注重核心机制建设
    农业如同人一样，是否健康不能只看外表，要看它的内在系统，如“血液循环系统”如何，“经络系统”如何，“代谢系统”如何等等。可以说，每个地方的农业都做得有鼻子有眼，但这个有鼻子有眼的农业是否健康，不取决于表面现象，内在系统才是关键。
    笔者认为，生态循环机制是决定农业内在系统是否健康的关键机制，也是新时期生态农业的核心机制。人的身体内在系统如果出现阻塞，人就不会健康。同样，生态循环机制没有建好，农业也不可能健康可持续发展。例如，秸秆是否循环利用了，畜禽粪便是否循环利用了。如果做好了生态循环的文章，农业的内在系统就健全了，农业上的很多根本性问题也就迎刃而解了：土壤的有机质含量就会不断提高，土壤的理化性状也会越来越好，耕地的质量问题也就随之提高了。在这样好的土地上，农业不仅会可持续增长，而且农产品质量也可以从源头上得到保证。
    3.1 生态农业核心机制建设的理论依据
    笔者长期从事生态循环农业研究，参与了大量的生态循环农业模式的实践。在实践过程中，为了让团队的每个成员都能准确地把握生态循环的要点，根据传统生态农业的精髓和市场经济环境的要求，归纳出了“价值循环理论”。同时，在和基层工作人员的合作中、在与专家学者的座谈和研讨中，笔者发现该“价值循环理论”有助于把握工作和思维的方向。因此，笔者认为，“价值循环理论”可以作为发展现代高效生态农业、促进农业可持续发展的最直接理论之一。
    “价值循环理论”可概述如下：
    现代社会的经济体不仅仅创造和实现价值，更应该关注价值的循环。从本质上来看，价值的循环可以保证在有限的资源条件下更多地创造和实现价值。如果经济体内部的所有物质单元（包括无机物和有机体）都能充分地以价值形式实现循环，才能向经济体外提供最大的价值总量。这里的价值总量是“正价值”量减去“负价值”量后的“净价值”量。所谓“正价值”，就是经济体提供的产品所体现的符合购买者需求的效用价值；所谓“负价值”，就是经济体的行为对资源环境和经济社会造成的负面影响对应的价值损失，这种价值损失有时不是直接体现在当下，而是在未来的一段时间里逐渐显现。衡量经济体的好坏不能只衡量“正价值”量，也就是说，经济体的成果中应该减去相应的“负价值”现值。
    经济体内部的物质单元如果附在产品上走出经济体，就会形成“正价值”，如果附在不再被循环利用的废弃物上走出经济体，就会形成“负价值”。只有物质单元在经济体内充分循环，多次地经过生产过程，才能更多地附在产品上走出经济体，经济体才会在同样资源投入的前提下形成较大的“正价值”量和较小的“负价值”量。
    如何才能使物质单元在经济体内多次地经过生产过程实现充分循环呢？只有用价值这只船载上物质单元，才能使他们畅通循环，因为经济体内部的各部分也是完全或不完全的经济理性单位，他们需要通过价值链进行交易，也就是说，他们计较的是价值。
    3.2 生态农业核心机制建设理论的诠释
    3.2.1生态农业的精髓是物质单元多次经过经济体内部的生产过程
    农业废弃物多为有机废弃物，收集并加以资源化处理，不仅可获得补充或代替能源,而且还可以增加农业生产资料，如种植业的有机肥、畜牧业的饲料、菌菇业的基料等，这是生态循环机制的一项重要内容。农业中的复合产业体系是实施生态循环机制的广阔天地，种植业、养殖业、畜牧业、菌菇业、农产品加工业以及新兴的旅游业、服务业等，完全可以利用生态循环链条连成一体，把以农产品生产为目的动脉产业和废弃物处理为主的静脉产业穿插结合，为物质单元多次经过生产过程创造条件，谋求资源的高效利用和废弃物的“零排放”，充分体现生态循环的本质要求，以实现农业产出高增长、农业资源消耗低增长、农业环境污染负增长的发展格局。
    3.2.2生态农业的目的是物质单元更多地附在产品上走出经济体
    这一部分是以上一部分为前提的，也就是说，如果经济体内部的物质单元多次经过生产过程，才能向经济体外提供更多的产品量,产生更大的价值总量。
    任何一个经济体，在产生产品的同时，总是要排放废弃物，尽管我们努力朝着零排放的目标努力，但或多或少地排放是一时无法完全避免的。如果物质单元多次经过生产过程，就可以更多地附在产品上而不是附在废弃物上走出经济体。例如，种植业的秸秆原本是有机剩余物，大多数情况下被当着废弃物，但如果还田或通过其他途径再利用，秸秆中的物质单元就可以转化为产品中的物质单元，不再是经济体排放的废弃物中的物质单元，经济体就可以提供更多的产品。
    附在产品上走出经济体就会形成“正价值”，附在废弃物上走出经济体就会形成“负价值”。因此，衡量经济体的好坏不能只衡量产品价值量，即“正价值”量，还应该减去相应的“负价值”。由于这种“负价值”对社会经济和生态环境的损耗不是完全直接体现在当下，而是在未来的一段时间里逐渐显现，因此每年减去的“负价值”应是分摊的现值。
    3.2.3生态农业的保障是用价值之船载上物质单元在经济体内畅通循环
    由上可知，只有让经济体内的物质单元多次经过生产过程，再能使物质单元更多地附在产品上走出经济体。但是，让物质单元在经济体内实现充分循环并不是件简单的事，必须有合理的运行法则来保障。
    我们知道，经济体内部的各部分也是完全或不完全的经济理性单位，他们的主要动力来源于利益的刺激。而利益的背后是价值的分配，也就是说，他们关注的主要是价值。
    因此，保障生态农业的发展需要建立这样的运行法则，它的基本内容就是用价值之船载上物质单元在经济体内畅通循环，这是“价值循环理论”的核心，也是生态农业得以有效运行的根本保障。例如，种植业的秸秆通过养殖业作为饲料过腹再还田回到种植业，他们之间（在一些地方还有秸秆收集中介、秸秆专业合作组织）需要在秸秆的价值链条上合理地交易才能保证这种生态循环模式的更好运行，也就是说，秸秆中的物质单元只有通过价值这只船才能在种植业与养殖业之间畅通无阻地循环。
    4 新时期我国生态农业发展的基本思路
    进入“十二五”，生态农业发展迎来了新的机遇。在环境污染日益严重，食品安全问题频发的现实压力下，公民的环保意识逐渐提升。同时，农业生产的主体也呈现多元化，专业大户、家庭农场、农业企业、合作社等经营主体逐渐替代一家一户的传统经营，为生态农业模式及技术体系的实施创造了条件。2012年党的十八大将“大力推进生态文明建设”独立成章，凸显了生态文明对我国未来发展的重大意义，为新时期生态农业的发展提供了良好的政策环境。
    新时期生态农业的发展目标就是建设现代高效生态农业。现代高效生态农业不同于传统生态农业，需要系统化的政策法规保障、规模化的运营模式承载、现代化的科学技术武装。
    4.1 用系统化的政策法规保障生态农业
    现代高效生态农业与一般农业发展模式相比，具有更强的正外部性，但同时却承担着更大的机会成本,弥补的办法就是实施扶持政策，建立激励机制，引导农业生产者的行为。同时，参考国际上成功的做法，我国还要完善相应的法规体系，建立相应的约束机制，规范农业生产者的行为。目前，我们在这些机制建设方面还处于起步阶段，因此，需要我们在深入的经济分析和农民意愿研究基础上，制定出能引导和保障现代高效生态农业快速发展的政策法规,并尽快形成有效机制。
    4.2 用规模化的运营模式承载生态农业
    农业适度规模经营，可以促进专业化生产、集约化投入、规模化产出，不断降低单位面积生产成本，不断提高经营主体的效益总量。同时，规模化是现代高效生态农业的前提，可以保障农业生态系统各子系统间的高效物质循环和能量转换，有效抵御大的自然灾害。当前，我国正在加速城镇化，农村土地闲置或利用不充分问题日益突出，开展农业适度规模经营具备了基本条件。因此，建议政府能够积极引导，提前制定规划；健全培训教育体系，加快培育生态农业职业农民；完善相关政策法规体系，在激励的同时加强监管；健全农业社会化服务体系，提供生产和市场保障。
    4.3 用现代化的科学技术武装生态农业
    面临保障农产品有效供给与保护资源环境双重压力的我国农业发展必须依靠科技，现代高效生态农业的核心支撑也是科技。要充分认清生态农业发展的技术需求与创新方向，既要注重挖掘传统生态农业技术精髓，又要创新现代农业技术，并进一步集成创新。传统生态农业的技术特点是精耕细作，重视资源环境与生态系统的保护，缺点是生产规模小、效率低、抵御自然灾害能力差。因此，要在挖掘传统生态农业技术精髓的基础上，采用现代农业技术弥补其缺陷，使生态农业转变成现代高效农业。然而，用现代农业技术优化传统生态农业技术，并不是简单的拿来，而是根据生态农业的不同类型进行集成，属于一种创新过程，这样才能使生态农业真正具有现代高效的技术内涵。