为进一步拓展国际合作空间，加强与国外研究机构的学术交流，2014年10月，农经所与日本贸易振兴机构亚洲经济研究所共同签署了为期五年的合作研究框架协议。协议内容主要包括中日合作研究的重点方向、具体合作方式、人员互派交流、共同举办国际研讨会和出版学术成果等。合作研究项目由农经所秦富所长牵头、孙炜琳副研究员主持，薛桂霞研究员担任总协调人。
早在上世纪80年代，农经所就开始与日本农业经济研究的相关机构开展合作交流。与亚洲经济研究所的合作始于2006年，双方主要在农业经济与政策领域开展合作研究、科研人员互访交流、学术研讨等活动。本协议是在农经所与亚洲经济研究多年友好合作关系基础上签署的。协议的签署为双方今后进一步加强合作、深化交流搭建了一个良好平台。
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